CAVATICA平台在澳大利亚的扩展使地理上分离和受司法保护的数据资源的协调分析成为可能

2020年6月2日，波士顿七桥, 业界领先的生物信息学生态系统提供商, 今天宣布Gabriella Miller儿童第一数据资源中心(Kids First DRC), 零儿童癌症(零), 儿童脑肿瘤组织协会(CBTTC), 澳大利亚生物共享和澳大利亚研究数据共享(ARDC). 多国基因组癌症研究项目旨在建立国际联合计算基础设施，使澳大利亚ZERO的儿童癌症数据与CBTTC和Kids First DRC的广泛基因组数据集协调一致. 通过这次合作, 研究人员希望更好地了解罕见的儿童脑癌亚型，并改善对患者及其家属的干预措施.

大规模癌症全基因组测序(WGS), RNA-Seq和甲基组分析对k8彩乐园官方免费下载对许多癌症的理解产生了重大影响, 包括病因学, 识别疾病亚型, 新的途径和新的药物靶点. 虽然全球有许多广泛的基因组癌症研究项目, most focus on adult cancer; however, 因为所有高危儿童癌症亚型都是罕见病, 亚型和基因组变异之间具有统计学意义的相关性本质上依赖于大样本数.

“在澳大利亚，儿童癌症导致的儿童死亡人数超过任何其他疾病，澳大利亚每周有三名儿童和青少年死于癌症,马克·考利说, Ph.D.他是儿童癌症研究所的副教授. “每个孩子都不一样, 每种癌症都是独一无二的, 所以治疗必须为每个人量身定制. 通过儿童癌症亚型的国际数据合作, k8彩乐园官方免费下载希望更好地了解如何治疗k8彩乐园官方免费下载在澳大利亚发现的癌症, 基于以前无法获取的信息.”

研究将在CAVATICA平台上进行, 用于协作访问的基于云的系统, 分享和分析儿童癌症数据. CAVATICA平台，由 七桥, 允许世界各地的临床医生和科学家在计算和存储环境中快速访问大量基因组数据和工作流程，他们可以共享, 过程, 整合和分析数据. Complex 和 comparative analyses can be achieved using various open source R 和 Python packages; 和 through the Data Cruncher feature, 数据可以通过交互式木星笔记本共享.

“CAVATICA平台使k8彩乐园官方免费下载能够无缝协作, 分享, 与其他研究儿童癌症的研究人员进行互动和联系, 推动改善的结果和新的研究,亚当·雷斯尼克说, Ph.D.，儿童第一数据资源首席研究员. “该平台使k8彩乐园官方免费下载能够协调和处理超过15个,000个全基因组, 全外显子组和rna测序, 包括对齐, 体细胞变异召唤, 拷贝号调用, 结构变异, RNA表达和融合. 另外, 与Kids First Data Resource Center门户的集成允许用户安全地创建队列并管理他们的分析, CAVATICA中基于云的项目.”

使这种跨国合作成为可能, CAVATICA平台正在进行扩展，以实现跨地理隔离和司法保护数据集的统一分析, 在这种情况下横跨澳大利亚和美国. 扩展的CAVATICA编排引擎将允许ZERO和Kids First工作流程和分析工具在两个数据集之间互换和无缝使用. 从研究者的角度来看, 该平台将不同的数据集聚合成一个虚拟的泛大陆数据集，该数据集可通过全球最佳实践分析平台高度访问.

“通过CAVATICA平台将儿科研究人员连接起来, k8彩乐园官方免费下载还通过使用全球标准的通用工作流语言(CWL)打破了数据孤岛之间的边界 多重云计算布兰迪戴维斯-杜森贝里博士说.D.他是七桥项目的首席科学官. “这使k8彩乐园官方免费下载的研究人员能够专注于治疗患有罕见癌症的儿童，而不是数据挑战.”

七座桥
七桥使研究人员能够从基因组和表型数据中提取有意义的见解，以推进精准医学. k8彩乐园官方免费下载完整的生物信息学生态系统由一个兼容的分析平台组成, 无缝数据和自动化, 以及专业的科学服务. 这种生物信息学的整体方法正在使世界领先的学术机构的研究人员, 生物技术, 政府, 医疗中心, 和制药实体-增加R&D效率, 加强假设解决过程, 分离关键生物标志物, 甚至可以扭转失败的临床试验，同时减少计算工作流程时间和数据存储成本. 欲了解更多信息，请访问 china80h.com 或者跟随k8彩乐园官方免费下载 LinkedIn 和 推特.

关于加布里埃拉米勒儿童第一儿科研究项目数据资源中心
美国国立卫生研究院共同基金支持的加布里埃拉·米勒儿童第一数据资源中心(儿童第一DRC)是一项合作儿科研究工作，旨在加速数据驱动的发现，并利用大型基因组数据集为被诊断患有癌症或结构性出生缺陷的儿童开发新的基于精确的方法. Kids First DRC由集成的核心团队组成，支持前沿大数据基础设施的开发，并为研究人员和临床医生提供必要的资源和工具.

作为共同基金加布里埃拉·米勒儿童第一儿科研究项目的一部分, 儿童优先委员会负责:

• 开发数据驱动的平台，整合来自不同疾病类型的大量基因组和临床数据.
• 授权协作发现, 订婚, 以及疾病群体之间必要的伙伴关系，这对于k8彩乐园官方免费下载对疾病的生物学理解的进步至关重要.
• 使诊断为儿童癌症或结构性出生缺陷的患者能够快速转化为个性化治疗.
• 加速发现这些疾病内部和之间的遗传原因和共享的生物途径.

关于儿童脑肿瘤组织协会
儿童脑肿瘤组织联盟(CBTTC)的使命是为诊断患有脑肿瘤的儿童寻找治疗方法并改进治疗方法. 为此目的, CBTTC收集高质量的脑肿瘤生物标本和相关临床数据，以促进生物标本的基因组分析. 培养细胞系，然后从肿瘤标本中创建可移植的肿瘤模型. 这些模型使研究人员能够与其他CBTTC成员机构和全球科学界分享他们的发现. CBTTC建立了一个多机构合作的组织和数据存储库，以便收集和分析高质量的脑肿瘤标本. 除了标本数据, 资料库也连结到临床资料，以提供每个独特肿瘤的全面快照.

另外, CBTTC致力于推进基于组织的研究, 让全世界的研究人员都能接触到脑肿瘤样本的分子分析. 这些举措将有助于改善对脑肿瘤患者的治疗.

关于澳大利亚生物共享资源
澳大利亚生物共享中心正在通过协调和提供全国范围内的生物信息学和生物科学数据基础设施，为澳大利亚生命科学研究建立数字能力. 重点是积极参与研究团体, 正在与国际对等基础设施合作开发和维护共享数字基础设施. 澳大利亚生物共享公司提供定制服务，提供复杂的分析能力, 包括软件和硬件平台. 培训和支持解决方案简化了对数字技术的访问, 对环境至关重要的数据和工具, 农业和生物医学研究. 欲了解更多有关的在线信息 澳大利亚BioCommons 或者跟随k8彩乐园官方免费下载 推特.

关于儿童癌症研究所
最初于1976年由两个患有癌症的孩子的父亲创立, 儿童癌症研究所是澳大利亚唯一一家完全致力于病因研究的独立医学研究机构, 儿童癌症的预防和治疗. 四十年过去了, k8彩乐园官方免费下载的愿景是拯救所有患有癌症的儿童的生命，改善他们的长期健康状况, 通过研究. 该研究所现已发展到雇用300多名研究人员, 操作人员和学生, 并在国内和国际上建立了卓越的科学声誉. k8彩乐园官方免费下载的重点是转化研究, k8彩乐园官方免费下载有一个由实验室研究人员和临床科学家组成的综合团队，他们共同合作，发现新的治疗方法，这些治疗方法可以尽快从实验室的工作台推广到k8彩乐园官方免费下载医院病房的儿童床上. 这些新的治疗方法专门针对儿童癌症, 因此，k8彩乐园官方免费下载可以开发出更安全、更有效的药物和药物组合，将副作用降到最低，最终为患有癌症的儿童提供最好的治愈机会，并尽可能提高生活质量. 更多的在 www.ccia.org.au.

关于零儿童癌症
“零”项目由儿童癌症研究所和悉尼儿童医院的儿童癌症中心领导, 兰德威克汇集了澳大利亚所有主要的儿童癌症临床和研究小组，为患有高风险或复发癌症的儿童提供澳大利亚有史以来第一个个性化的药物计划.

关于澳大利亚研究数据共享
澳大利亚研究数据共享(ARDC)是一项变革性的倡议，使澳大利亚研究社区和行业能够获得具有全国意义的数据, 领先的数据密集型基础设施, 平台, 技能和高质量数据的收集. k8彩乐园官方免费下载的目的是通过数据为澳大利亚研究人员提供竞争优势. 欲知详情，请浏览 在线 或者跟随k8彩乐园官方免费下载 LinkedIn 和 推特.

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