协作
该平台是为分布式研究小组设计的. 因为所有的工具, data, 计算能力存在于云中或组织的数据中心, 你可以和你的团队一起工作, 无论你在哪里.
通过指定团队成员的访问级别来安全地协作, 包括阅读, 写, 以及执行权限. 使用平台的评论系统,围绕重要的基因组区域进行讨论. 这些资源都得到了工程和研究的支持,并且越来越多, 全球用户社区.
安全性和合规性
七桥和您一样重视数据和结果的安全性. k8彩乐园官方免费下载平台的每个方面都是为处理机密患者信息而设计的,并符合管理健康记录的所有标准.
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基础设施
平台可以在虚拟私有云中运行, 本地高性能计算环境, 或者两者的混合.
七桥平台是唯一一个与最大的公共基础设施提供商亚马逊网络服务(Amazon Web Services)合作的主要生物医学数据分析平台, 阿里巴巴, 微软Azure和谷歌云. 这意味着您可以将数据存储在一个云上,并将您的工具和研究问题带到数据中.
七桥平台是使用混合云的支持技术,您可以在本地构建管道并分析数据, 但是,当您需要更强大的计算资源或本地基础设施任务过重时,请使用云. 《纲领》保持不变, 因此,您可以在熟悉的环境中跨不同的基础结构工作. 通过k8彩乐园官方免费下载帮助开发的通用工作流语言,在不同位置之间移动工具和管道变得很容易.
可伸缩性
通过弹性地扩展计算实例的数量和类型——除了优化并行运行的管道之外——在七桥平台上可以运行的执行次数和可以分析的数据量没有限制.
此外,弹性缩放还大大减少了任何给定管道的处理时间. 例如,平台可以完成一个GATK 2.3个Lite全基因组管道在大约5小时内完成,比在单个基于云的节点上执行的典型执行速度快两倍多.
应用程序和工作流程
七桥平台拥有一个完整的生物信息学工具和工作流程库. 七桥的生物信息学家维持了超过 550个工具和工作流,确保最新版本始终可用.
了解更多可用信息 工具.
可视化
该平台提供了一套完全可定制的可视化工具. 它还包括七桥互动 基因组浏览器 专为合作调查而设.
再现性
研究和临床试验取决于科学家复制结果的能力. 这就是为什么k8彩乐园官方免费下载让平台上的所有分析都是可重复的. 每一个工具, 版本, 参数, 分析中使用的数据会自动记录下来,只需点击一下就可以查看.
这个完整的记录允许您跟踪哪个执行产生了特定的输出文件. 它还允许任何人(从远程同事到期刊编辑)验证您的结果,而无需分发代码或配置执行环境
SDK
七桥平台是完全可定制的.
使用七桥软件开发工具包(SDK)将您自己的软件和专有工具带入平台. 托管您选择的工具,并与其他“黄金标准”研究工具和管道一起无缝地执行它们. 使用您喜欢的数据集或来自最大的公开可用数据库的样本.
学习 更多关于平台上的应用程序以及如何添加自己的应用程序的信息.
API
该平台使用七座桥实现自动化 应用程序编程接口 – upload and manage data; configure and initiate pipeline executions; and explore and download the results.
将平台与更广泛的系统和工作流程集成, 包括LIMS, 测序机器, 分析包(e).g., R, Java, 木星实验室笔记本, 和Python),), 以及端到端数据分析的诊断报告服务.
精度
准确分析生物数据是七桥和k8彩乐园官方免费下载所有客户的首要任务. 平台的每个功能都协同工作,以确保您的结果没有错误. 该平台使用最先进的生物信息学工具并实施最佳实践管道. 更重要的是,当需要在精度和速度之间进行权衡时,k8彩乐园官方免费下载总是确保前者. 最后, k8彩乐园官方免费下载的研发团队不断改进最准确的变异检测方法:图谱基因组参考.
图基因组
七桥 伯爵™Suite包括生物信息学工作流程和用于二次分析下一代测序(NGS)数据的工具, 基于泛基因组图参考,揭示对整个种群的更深入的见解.
七桥的伯爵是一个自我改进的系统,用于使用图形而不是碱基串来表示和分析基因组信息. 它允许科学家大量压缩数据,从而以前所未有的规模进行操作. 这是一种非常准确的检测个体遗传变异的方法, 随着每增加一个新的序列到图中,这种准确性就会提高. 它还提供了个人基因组序列的完全匿名性.
了解“七座桥” 图基因组 工具套件.