概述
从事基因组数据工作的生物技术公司可以通过将生物信息学流程从业务流程中分离出来,降低风险,并显著加快上市时间. 而不是花9到12个月的时间建立自己的部门, 集群, 软件过程, 和存储, 公司选择了七桥,这意味着他们的生物信息学解决方案比他们准备第一个测序库的速度要快.
分子标记
正欲 (BD)的科学家们着手消除现代RNA测序中最大的痛点之一:不仅仅是理解 哪一个 转录本是表达的,但计数准确 有多少 在特定细胞中表达.
传统的RNA-Seq通常用于转录物的定量,而BD分子索引则用于转录物的定量TM Kit部署了一种新的分子标记解决方案. 这使得研究人员可以在扩增和测序之前对每个单独的RNA分子进行独特的标记, 从而获得高度精确的定量结果. 这些标签允许在排序后进行重复数据删除, 这意味着生物学家可以准确地重建原始样本中转录本的确切数量.
然而,对于BD来说,新型化学只是一个开始. 他们也需要客户, 准确的, 以及易于使用的生物信息学软件来解读标签背后的含义.
开发,交付,更新和支持生物信息学工具
最初,BD通过可下载的二进制文件交付他们的定制工具. 然而, 他们发现这很难支持,并创造了一个不那么引人注目的客户体验. 通过这种方法, 用户在安装工具时遇到了麻烦, 在本地机器上运行它们通常是一个缓慢的过程. 此外, 事实证明,让客户使用提供了关键错误修复的最新版本是很困难的, 而且,在世界各地各种各样的系统上支持安装是非常昂贵的. 经过对市场的全面调查, BD认为,为客户服务的最佳方式是与七桥合作,大规模提供他们的生物信息工具, 通过云.
为BD用户定制的基于云的门户
Seven bridges和BD合作决定如何最好地交付他们的定制工具. 团队共同决定为BD的用户定制门户是最佳选择. 将这些工作流放置在 七桥平台 意味着BD可以专注于质量改进, 立即将每个人更新到他们工具的最新版本, 并完全消除他们的软件支持负担.
七桥团队开始使用BD现有的工具. 第一个, 在了解这些工具如何运作的过程中, 研究小组不仅发现了它们目前的功能, 同时也对如何提高他们的表现提出了建议. 接下来,团队成为了k8彩乐园官方免费下载成熟的内部客户 软件开发工具包 (SDK)——基于开源的通用工作流语言——它允许任何人轻松地将他们的工具和工作流移植到七桥平台上.然后,BD将项目移交给七桥的前端和后端工程团队. 最后,前端团队为BD用户准备了一个定制的门户.该门户允许生物学家轻松请求访问 七桥平台 并将其数据直接加载到具有最佳实践工作流的项目中.
结论
科学家们通过选择七桥作为他们的生物信息学解决方案来加速研究和分析项目. 通过与七桥的科学和生物信息学团队合作,团队用户能够利用先进的定制工具和工作流程, 这样他们就可以专注于手头的科学. 在云端交付的高级生物信息学工作流程提供了大规模的最新分析解决方案. 像双相障碍, 您可以通过最佳实践工作流程来加强您的研究游戏, 一流的用户支持, 以及七桥平台的专业知识.